La tendencia a disociarse esta dada por el pK.
pK1: Grupo carboxilo
pK2: Grupo amino
pKR: Cadena Lateral
Aminoácido | pK1 | pK2 | pKR |
Glicina | 2,4 | 9,8 | -- |
Alanina | 2,4 | 9,9 | -- |
Valina | 2,3 | 9,7 | -- |
Leucina | 2,3 | 9,7 | -- |
Isoleucina | 2,3 | 9,8 | -- |
Metionina | 2,1 | 9,3 | -- |
Prolina | 2,0 | 10,6 | -- |
Fenilalanina | 2,2 | 9,3 | -- |
Triptófano | 2,5 | 9,4 | -- |
Serina | 2,2 | 9,2 | -- |
Treonina | 2,1 | 9,1 | -- |
Cisteína | 1,9 | 10.7 | 8,4 |
Tirosina | 2,2 | 9,2 | 10,5 |
Asparragina | 2,1 | 8,7 | -- |
Glutamina | 2,2 | 9,1 | -- |
Ácido aspártico | 2,0 | 9,9 | 3,9 |
Ácido glutámico | 2,1 | 9,5 | 4,1 |
Lisina | 2,2 | 9,1 | 10,5 |
Arginina | 1,8 | 9,0 | 12,5 |
Histidina | 1,8 | 9,3 | 6,0 |
Fig.3
Ejemplo: aspartato a diferente pH.
Aspartato | pH | |||||||||||
GRUPO | pk | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 |
pk1 | 2 | 0 | -0,5 | -1 | -1 | -1 | -1 | -1 | -1 | -1 | -1 | -1 |
pk2 | 10 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 0,5 | 0 |
pkR | 4 | 0 | 0 | 0 | -0,5 | -1 | -1 | -1 | -1 | -1 | -1 | -1 |
carga total | 1 | 0,5 | 0 | -0,5 | -1 | -1 | -1 | -1 | -1 | -1,5 | -2 | |
pK > pH → grupo está protonado
pK = pH → grupo está disociado en un 50% (si es carboxilo será con signo – y si es amino +)
pK < pH → grupo está desprotonado
En el ejemplo anterior se debió calcular la carga del aa. tomando en cuenta que en su cadena lateral, poseía un grupo γ carboxilo que le da la característica de ser un aa. ácido. En el caso de que en la cadena lateral no exista un grupo en el R que pueda disociarse se calculara la carga neta tan solo con los grupos alfa-amino y alfa carboxilo. La carga neta de un polipéptido también puede ser calculada, en este caso solo se consideran los aa. terminales ya que los demás tienen sus grupos alfa-amino y alfa-carboxilo unidos. En el caso del N-terminal se considera la carga de su grupo amino y en el C-terminal la carga del grupo carboxilo, además se deben considerar las cadenas laterales que tengan la capacidad de disociarse.
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